基礎醫學和臨床醫學的區別主要有以下幾點：

1.專業學習的側重點不同

基礎醫學研究醫學基礎學科，如解剖、生理、生化、微生物等等學術性內容，臨床醫學是以內外婦兒、五官科、眼科、皮膚科等等臨床應用學科的內容，學習的課程涵蓋幾乎所有的醫學課程，就是兩個醫學專業都需要學習基礎+臨床課程，只是重點側向部分課程；同時，臨床醫學專業還有一年的臨床實習期，這是基礎醫學沒有的。

2.專業大方向和要求不同

基礎醫學主要是偏向理論學習和理論研究，其臨床醫學則更具實踐性。學習基礎醫學需要學生識記和掌握很多的理論知識，同時要參與很多的理論實驗，最終能驗證某個醫學理論或發展與創新某個醫學理論，因而學習基礎醫學的學生要有學術潛質；而臨床醫學則要求學生膽大心細，直接面對病人，在學習理論知識的基礎上應對各種突發情況、判斷和處理各種疑難雜癥。

3.專業培養目標不同

基礎醫學專業培養具備自然科學、生命科學和醫學科學基本理論知識和實驗技能，能夠在高等醫學院校和醫學科研機構等部門從事基礎醫學各學科的教學、科學研究及基礎與臨床相結合的醫學實驗研究工作的醫學高級專門人才。

臨床醫學專業本培養德、智、體、美全面發展，具有良好職業道德和人文素養，掌握基礎醫學和 臨床醫學基礎理論、基本知識和基本技能，具備常見病、多發病診治和預防能力，以及危、急、重癥的初步判斷和處理能力，從事基層醫療衛生服務工作的高素質實用型醫學專門人才。

4.就業方向不同

基礎醫學的畢業生今后主要從事研究工作，因而可以去各個研究所工作，或是在學校搞教學，或去生物技術公司、醫療技術公司等。另外，基礎醫學專業可以在大四申請出國讀，去美德這些基礎醫學做得比較好的國家做研究也是不錯的選擇。

臨床醫學專注于實際操作，也就是最好當醫生，可從事麻醉學、醫學影像學、醫學檢驗、放射醫學、視光學 、醫療美容技術 、醫學檢驗技術等多個方向的工作。