審計、稅務（企業會計與稅務）、市場營銷、國際商務、國際貿易實務(國際物流與報關)、電子商務、連鎖經營管理、計算機應用技術、計算機網絡技術、嵌入式系統應用開發、軟件技術、旅游管理、會展策劃與管理、酒店管理(旅游與酒店管理)、旅游英語、裝潢藝術設計、廣告設計與制作、服裝設計、旅游工藝品設計與制作、新聞采編與制作、文秘、信息傳播與策劃、主持與播音、應用英語、應用日語等。近年來，學校還與西南交通大學、北京語言大學、東北財經大學等聯合辦學，開辦本科層次的網絡教育、函授教育。學校十分重視教學與科研齊頭發展。學校主辦有國內外公開發行的學術刊物《福建商業高等專科學校學報》。學校教師主持或參與的各級、各類科研項目98項，其中省級3項，教育廳32項，在全國各級學術刊物上發表教研、科研論文700篇，出版專著11部，主編或參編教材37部，其中有3部教材獲獎。學校擁有2門省級精品專業，省級教學成果獎2項，8門省級精品課程，4門省級精品課程立項。學校的人才培養工作成績斐然。學校升格至今，已為社會培養了三萬多名各類應用型商貿管理人才。隨著市場經濟的不斷深入，學校提出“為商界打造人才，為人才打造品牌”的口號，重視學生“出口”，突出實踐教學。畢業生以專業理論扎實、實踐能力強、職業道德好、合作意識強、適應工作快、發展后勁足等特點深受用人單位歡迎。據省人事廳統計，學校2006、2007、2008年畢業生年底就業率分別達：97.5%、95.9%、98.1%。2007年，獲得福建省高校畢業生就業工作評估檢查高職專科組第一名。隨著經濟建設步伐的加快，教育改革的不斷深入，學校堅持“以人為本，質量為先”的原則，繼續深化改革、加快發展、提高質量，為培養高素質的應用型人才提供良好的環境，為建設海峽西岸經濟區打造更多的復合型、應用型的“新一代閩商”人才。