等獎5項、省級教學成果獎33項。學校獲全國首屆優秀高等教育研究機構。
學校現有科技部中醫藥國際科技合作基地1個，黑龍江省中醫藥國際科技合作基地1個，黑龍江省科技創新臺1個，黑龍江省工程技術中心1個，教育部省部共建重點實驗室1個，國家中醫藥管理局重點研究室3個，國家中醫藥管理局三級實驗室10個，省重點實驗室3個，省普通高等學校重點實驗室4個，黑龍江省科技創新團隊1個。“十五”以來，獲得各級各類科研課題立項1309項，其中國家“973”項目3項、“863”項目1項；獲得各級各類獎勵419項，其中：國家技術發明二等獎1項、國家科技進步二等獎6項；高校自然科學一等獎1項、中華中醫藥科技進步一等獎2項、黑龍江省科技進步一等獎5項。在中藥血清藥物化學研究、中藥天然藥物藥效物質基礎研究方面處于國際先進水，在方劑配伍規律、針灸作用機理研究和中醫藥治療內科、婦科、腎病等重大疾病的臨床研究方面處于國內領先水。2008年，學校培養的博士撰寫的論文獲得教育部、國務院學位委員會“全國優秀博士學位論文”，又獲“全國優秀博士學位論文提名論文”，成為全國第三個獲此殊榮的中醫藥大學。
學校附屬第一醫院（臨床醫學院）為國家中醫臨床研究基地建設單位、國家三級甲等醫院、全國示范中醫醫院、全國醫藥衛生系統先進集體，全國三八紅旗先進集體。學校附屬第二醫院（針灸推拿學院）是以針灸推拿康復為的三級甲等醫院，為全國首批現代化中醫院建設單位。兩附院有國家級醫療中心和重點專科7個、省級醫療中心和重點專科11個。
學校現有教職工2486人（校本部1117人）。其中教授、副教授及相應職稱人員685，博士研究生導師92人，碩士研究生導師219人，有38位專家享受政府特殊津貼，衛生部有突出貢獻中青年專家3名，百千萬人才工程國家級人選4人，國家級教學名師3名，全國巾幗建功標兵1名，全國優秀工會干部2人，全國優秀教師6名，在職全省勞動模范4人，省女職工建功立業標兵崗1個，建功立業標兵2名，全省五一勞動獎章1名，藥學院和學校先后獲得省五