學院占地面積72.5萬方米，建筑面積31.7萬方米，圖書館藏書100多萬冊，中外文期刊2300多種，校園網絡系統先進，擁有各類網上教學資源3000多部。教學科研儀器設備總值1.7億元，固定資產總值6.5億元。《牡丹江醫學院學報》在全國公開發行。

學院有8所附屬醫院，總床位數6116張。其中直屬附屬醫院2所，床位2000張。附屬紅旗醫院是具有1200張床位的 “全國百姓放心醫院”、“全國示范醫院”，是黑龍江省東南部地區具有明顯優勢的三級甲等醫院。

學院面向全國25個省(市)、自治區招收本科生，現有全日制在校本、專科學生10114人。開設臨床醫學、醫學影像學、麻醉學、醫學檢驗學、護理學、康復治療學、口腔醫學、藥學、制藥工程、藥物制劑、預防醫學、信息管理與信息系統、公共事業管理、應用心理學、市場營銷、醫學影像技術、生物醫學工程17個本科專業。其中口腔醫學專業列為本科一表招生，醫學影像學、臨床醫學、麻醉學、醫學檢驗專業是省級重點專業，醫學影像學專業是省級一類專業和國家級一類建設專業。人體解剖學、組織胚胎學、生物遺傳學、病原生物學、影像設備學、診斷學是省級精品課程。

基礎醫學、生物學、藥學3個一級學科及內科學、影像醫學與核醫學、外科學3個二級學科被評為省級重點學科，“抗纖維化生物治療”實驗室是黑龍江省重點實驗室，“麻醉與危重病學”實驗室是與哈爾濱醫科大學協作的黑龍江省重點實驗室，“組織損傷與修復”實驗室、“腫瘤疾病防治”實驗室是黑龍江省高校重點實驗室。“生物化學與分子生物學實驗室”、“生物學實驗室”、“藥學實驗室”是中央與地方共建高校基礎實驗室。學院設有省級生物醫藥技術服務臺、校企共建工程技術研發中心和牡丹江市北藥開發實驗基地。學院還被列為全省應用型本科院校建設單位。

人體解剖與組織胚胎學、病理學與病理生理學、生理學、生物化學與分子生物學、內科學、影像醫學與核醫學、藥理學等學科于1997年開始與佳木斯大學、黑龍江中醫藥大學聯合培養碩士研究生519人，已取得碩士學位人員223人。

2007年以來，我校教師共參編國家規劃教材95部,其中主編9部，副主編16部。承擔國家級科研課題29項，承擔省部級科研課題55項，承擔廳局級項目417項。獲得省部級科研成果獎勵25項。2009年，獲得國家技術發明二等獎1項。發表科技論文2400多篇，180多篇論文被SCI、EI收錄。

學校和俄羅斯海參崴國立醫科大學、菲律賓法蒂瑪大學、韓國首爾大學醫學院、韓國仁川醫科大學等國外院校建立了交流與合作關系。

學校始終把教育教學放在中心地位，強化素質教育，注重學生實踐能力、動手能力、思維能力的培養，學生綜合素質和適應能力不斷增強，受到用人單位的歡迎，得到了社會的廣泛認可。

學校遵循發展是第一要義的科學發展觀，堅持“為農村辦學、為基層服務”，把建設和實現小康社會作為辦學的責任。曾受到書記處、國家教育部、國家衛生部的高度評價，1989年榮獲國家優秀教學成果特等獎。

建校以來，培養各級各類醫學、藥學畢業生5萬人，為黑龍江省和國家醫療衛生事業做出了重要貢獻。

目前，全校教職工秉承“立德立行、唯實唯新”的校訓，發揚“執著、愛校、求實、合作、創新、奉獻”的牡醫精神，為學院實現跨越式發展堅持不懈，共同奮斗!