南京審計學院是我國唯一以“審計”命名、以審計為品牌、經管法文理工等學科相互支撐、協調發展的財經類高等院校。學校前身為始建于1983年的南京財貿學院；1987年更為現名；1991年由審計署直屬；2000年調整為江蘇省與審計署合作共建、以江蘇省管理為主；2002年原南京金融高等專科學校并入，組建新的南京審計學院；2009年被國務院學位委員會列為碩士學位授權立項建設單位。

學校與中國審計事業同步發展，“為審而立、依審而興、靠審而強”。辦學管理體制調整后，審計署依然一如既往地全方位支持南京審計學院事業發展。全國政協副主席、前審計長李金華擔任我校名譽院長，歷任審計長、副審計長以及一批業務骨干擔任學校榮譽教授，經常親臨講壇；美國、法國等十多個國家審計長擔任我校榮譽教授，每年來校講學。學校依托行業優勢和區位優勢，努力將豐富的行業資源和優質的區域資源轉化為學校的辦學資源，進而轉化為學校獨特的辦學優勢，取得了跨越式發展。

學校現有浦口和莫愁兩個校區，占地2200余畝。浦口新校區校園山水相間，樹石相融，遍植松竹梅菊。樓宇采取新古典主義建筑風格，行走其間，移步換景，見湖光瀲滟，聞書聲朗朗，呈天人合一之境。

學校面向全國招生，現有在校全日制本科生、留學生近兩萬人。設有11個二級學院、3個教學部以及1個獨立學院、1個繼續教育學院，設有26個本科專業。其中，審計學、金融學、財政學為國家級特色專業建設點，審計學、金融學為江蘇省品牌專業，財政學為江蘇省特色專業，信息管理與信息系統、國際經濟與貿易、會計學、工商管理為江蘇省特色專業建設點。2007年以“優秀”等級通過教育部本科教學工作水平評估，2009年“審計高等教育理論探索與實踐創新”獲江蘇省高等教育教學成果特等獎和國家級優秀教學成果二等獎。