級基建管理制度和15項基建部門內設制度的基礎上，有針對性地制定或修訂了《基建項目立項報批和計劃管理辦法》、《基建項目工程變更及簽證管理辦法》、《建設工程投資控制管理辦法》、《建設工程質量管理辦法》等制度，進一步規范基建各環節工作流程。復旦校方重新設計修繕工作管理架構和基本流程，修訂了《修繕工程管理辦法》。

　　在校辦企業及校轄醫院方面，復旦大學也制定了一系列新的內控政策，以遏制腐敗。校辦企業方面，學校明確處級以上干部未經學校批準一律不得在企業兼職，并對教師辦企業和在企業兼職取酬情況開展了專項清查，未來將研究出臺規范教師開辦企業、在企業和其他單位兼職行為的管理制度;附屬醫院方面，學校將加強對附屬醫院大型醫療器械、藥品和耗材采購的監管，在大型醫療器械、藥品及耗材采購等領域建立附屬醫院共享專家庫等。

　　據悉，復旦大學在接到中央巡視組巡視通報后，制定了《關于中央巡視組專項巡視反饋意見的整改工作方案》和《任務分解表》，包括4個方面、56項整改任務，并將其細化為91項整改事項。在91項整改事項中，預定于9月底前完成的60項已基本完成，其余31項正按計劃有序推進。