2015年12月14日，教育部正式批準學校更名為西南醫科大學。

2016年1月18日，西南醫科大學正式掛牌。

2016年1月26日，教育部官網公開發布了“教發函[2015]144號”：《教育部關于同意四川醫科大學更名為西南醫科大學的函》。教育部相關負責人表示，教育部依法批準四川醫科大學更名西南醫科大學，考慮到高校校名之間歷史和傳承關系以及區域高等學校布局結構實際情況，為維護相關高校合法權益與教育系統和諧穩定局面，同時從貫徹十八屆五中全會精神，增強高等教育服務西南地區基層醫療衛生事業發展能力，優化區域高等教育布局出發考慮，所以同意四川醫科大學更名為西南醫科大學。“變更為‘西南醫科大學’并不意味著學校層次規格的提高，而是反映了教育部和四川省希望該校利用其川滇黔渝四省市結合部的地域優勢，發揮其辦學特色，更多承擔服務西南地區基層醫療事業的功能定位。”

師資力量

據2016年2月學校官網顯示，學校本部專任教師近千人，其中具有碩士及以上學位的人員超過70%，具備高級職稱的比例超過50%；在三所直屬附屬醫院臨床教師一千余人，并具有碩士及以上學位或中級及以上職稱。有國家“百千萬人才工程”第一、二層次人選1人，享受國務院政府特殊津貼專家30人，全國師德先進個人1人，全國優秀教師3人，教育部“”講座教授1人，教育部“新世紀優秀人才支持計劃”4人，四川省“”引進人才1人，四川省學術技術帶頭人10人，四川省教學名師5人，四川省優秀教學團隊4個，四川省師德標兵1人，四川省教育系統優秀教師7人，四川省優秀青年教師標兵1人，四川省有突出貢獻優秀專家23人，四川省學術技術帶頭人后備人選88人，廳局級和市級學術技術帶頭人及后備人選148人。