南京理工大學是雙一流大學。南京理工大學是隸屬于工業和信息化部的全國重點大學，2017年，學校入選“雙一流”建設高校，“兵器科學與技術”學科入選“雙一流”建設學科。

學校學科門類齊全，辦學鮮明。現有機械工程學院、化工學院、電子工程與光電技術學院、計算機科學與工程學院、經濟管理學院、能源與動力工程學院、自動化學院、理學院、外國語學院、公共事務學院、馬克思主義學院、材料科學與工程學院、格萊特研究院、環境與生物工程學院、設計藝術與傳媒學院、知識產權學院等15個專業學院，以及錢學森學院、中法工程師學院、國際教育學院、創新創業教育學院、繼續教育學院，并與合作方聯合創辦了南京理工大學紫金學院和南京理工大學泰州科技學院兩個獨立學院。

學校在長期發展過程中形成了兵器與裝備、電子與信息、化工與材料三大優勢學科群，工程學、化學、材料科學、計算機科學4個學科進入ESI國際學科領域全球排名前1%，其中，工程學進入前1‰。現有國家重點學科9個，江蘇省優勢學科6個，江蘇省重點學科9個，工信部重點學科7個，國防學科10個；國家級一流本科專業14個，國家級專業9個，教育部卓越工程師培養計劃試點專業13個；博士后流動站16個；一級學科博士學位授權點18個、碩士學位授權點17個；具有碩士專業學位授權類別19個；具有高級管理人員工商管理碩士（EMBA）授予權；具有在職人員以同等學力申請博士、碩士學位的授予權以及外國留學生和港澳臺學生的招生權。