云南大學是雙一流大學。1978年云南大學被國務院確定為全國88所重點大學之一，1996年首批列入國家“211工程”重點建設大學，2001年列入西部大開發重點建設院校，2017年成為中國首批42所“一流大學”建設高校之一，2018年躋身于中西部14所“以部為主、部省合建”高校行列。

云南大學下設26個學院、10個研究機構、2個獨立學院，1個附屬醫院，設有研究生院。

云南大學有本科專業79個，17個本科專業入選國家“雙萬”計劃，13個專業入選省“雙萬”計劃，有12個國家專業，6個專業“菁英班”，10個專業“卓越班”，3門“國家精品在線開放課程”；有21個一級學科博士學位授權，42個一級學科碩士學位授權，22個專業碩士學位授權。

在教育部第四輪學科評估中，學校有30個學科進入全國前70%，其中，A類學科2個（民族學為A+，生態學為A-），B類學科14個。化學、植物學與動物學學科進入全球ESI前1%。