廈門大學的王牌專業有經濟學類專業、管理類專業、化學化工專業、國際法專業以及歷史學專業等。

經濟學專業

經濟學院是廈門大學規模最大的學院之一，也是我國國內率先成立的經濟學院之一，在國內經濟學學科排名一直是名列前茅的，其下屬的財政學、統計學、金融學、政治經濟學4個學科在國內更是具有重大影響。為國家培養出了大量的統計學人才。學院名師匯聚，教學科研條件優厚，還成立了第一家經教育部批準設立的網絡經濟 本科專業，并擁有碩士和博士點，而且一直保持著很高的就業率。網絡經濟學是一門旨在探索經濟學前沿理論的邊緣型學科，它比電子商務研究得更為寬泛和綜合， 不但要學習網絡技術，而且還要不斷地更新知識，以保持學科的持久生命力。

管理類專業

管理學院是廈門大學實力非常強的學院，是我國第一個組織和開展MBA教育的機構，其下設的MBA中心，一直走在全國前沿。它出版了第一套MBA教材，授予了國內第一個MBA學 位，主持編寫了第一本全國各高校MBA通行的教學大綱，為中國本土商業管理培養了數千名精英。在工商管理一級學科評估中，管理學院名列第三，值得一提的還有管理學院的會計專業，其學科在全國高校中一直排名前三。廈大的會計發展研究中心，是國家文科重點研究基地，也是全國僅有的兩個國家級會計研究基地之一。 學科各個層次教育水平都很高，本科生的就業率是整個廈門大學最高的。

化學化工專業

化學化工是廈門大學的老牌學院，學術氣氛十分濃厚，師資力量也是十分強大的，任課教師中有7位是中科院的院士，1位中國工程院院士，這樣雄厚的師資，在全國都是非常少見的。

國際法專業

廈門大學的國際法專業在全國有很高的知名度，已經成為廈門大學最牛的專業之一。廈大的國際投資法也站在了國內投資法學術研究的最前沿。

歷史學專業

廈門大學的歷史學科可是我國高等院校中屈指可數的重點學科，尤其是1988年廈門大學中國社會經濟史學還被評為全國重點學科;該校的考古專業以中國東南地區的考古學區域性綜合研究為特色。