深圳大學最好的王牌專業有計算機專業、建筑學專業、土木工程專業、光學工程專業、生物醫學工程專業以及信息與通信工程等專業。

深圳大學最擅長的是工學相關專業，計算機、建筑學、土木工程、光學工程、生物醫學工程、信息與通信工程都不錯，除了工學之外，人文社科類的新聞傳媒、經濟學、法學也都不錯的。

國家級特色專業建設點：電子信息工程、建筑學、工商管理、計算機科學與技術、金融學。

省級特色專業建設點：電子信息工程、建筑學、工商管理、計算機科學與技術、金融學，生物技術、法學、廣告學、光信息科學與技術、自動化。

省級重點學科：光學工程、政治經濟學、國際法學、文藝學、傳播學、光學、細胞生物學、材料物理與化學、通信與信息系統、信號與信息處理、建筑設計及其理論、結構工程。