北大醫學部和北大雖然招生代碼不一樣，但是北大是包括北大醫學部的，準確的來說它們是一所學校，但北大醫學部從某些方面來說相對北大又是獨立的。

想要知道北大醫學部和北大的關系，我們可以先了解一下北大醫學部的歷史。北京大學醫學部前身是國立北京醫學專門學校，是中國政府教育部依靠自己的力量開辦的第一所傳授西方醫學的國立學校。

在2000年4月3日，原北京醫科大學與北京大學正式合并，組建新的北京大學。2000年5月4日，北京醫科大學正式改名為北京大學醫學部。所以，雖然北大醫學部和北大所在校區不同，招生代碼也不同，但是北大醫學部還是屬于北大的的。

北大醫學部是北京大學的一個學部，是北京大學的重要組成部分之一。說的直白點，就是在畢業的時候，北大醫學部的學生畢業證上寫的畢業院校依然是北京大學。

北大醫學部雖然是北大的學部之一，但因為在合并前有很高的知名度，包括醫院實力，聲望，校友資源等都達到了極高的影響力。

所以，在和北大合并的時候，底氣十足，在經過各種博弈妥協后，最終以醫學部的形式和本部合并，但保留了醫學部行政體系的獨立，這也是為什么北大醫學部有獨立的招生代碼，可以單獨劃線招生。