辦學資金來源不同。一般民辦學校、獨立學院學費高于公辦學校。一般獨立大學的附屬學院頒發的畢業證是不一樣的，企業也是不認可的。

公辦大學：就是指由政府舉辦的院校。

民辦高校:是指國家機構以外的社會組織或者個人，利用非國家財政性經費，面向社會舉辦的高校及其他教育機構。

獨立學院:是由普通本科高校與社會力量即企業、事業單位，社會機構或個人合作舉辦的進行本科層次教育的高等教育機構。

民辦高校與國家舉辦的高校都是國家審定具有普通高校招生資格的高校，在校生和畢業生的待遇都是一樣的，只是經費來源不同。

獨立學院（也叫二級學院）所頒發的學歷和文憑在社會認可度上低于公立院校（一級學院），由于大部分獨立學院主要還是在本科第三批次招生，少量獲得本科第二批次招生資格，其生源質量相對于一級學院還是有一定差距。