級學科、53個二級學科具有碩士學位授予權。
“十一五”期間，學校共承擔國家級、省部級科技計劃項目1050項，學科建設與科研總經費1.5億元；在國際性和國家級期刊發表科研論文3700余篇，其中SCI收錄論文347篇；出版教材著作648部；獲省部級科技獎勵142項，獲專利授權62項。
直屬附屬醫院中，第一醫院、第二醫院是山西省規模最大的綜合性三級甲等醫院，全國百姓放心醫院，共開放床位2473張，技術力量雄厚，醫療水平領先；口腔醫院是省內唯一一所三級乙等口腔專科醫院，擁有日本森田3D牙科CT機、德國西門子數字化全景機等一批先進醫療設備，開放牙科綜合治療椅76臺。
學校與美國、日本、德國、意大利、澳大利亞、香港、臺灣等國家和地區多所院校建立了教育、科技、醫療合作關系。
經過九十多年的薪火相傳，經過幾代人的艱辛拼搏，山西醫科大學取得了輝煌的成就。在未來的征程中，學校將繼承優良辦學傳統，加快發展步伐，為建成建好特色鮮明的教學研究型醫科大學而努力奮斗。