F值是兩個均方的比值（效應項/誤差項），不可能出現負值。F值越大（與給定顯著水的標準F值相比較）說明處理之間效果（差異）越明顯，誤差項越小說明試驗精度越高。

什么是方差分析

方差分析，又稱“變異數分析”，是R.A.Fisher發明的，用于兩個及兩個以上樣本均數差別的顯著性檢驗。由于各種因素的影響，研究所得的數據呈現波動狀。造成波動的原因可分成兩類，一是不可控的隨機因素，另一是研究中施加的對結果形成影響的可控因素。

方差分析的基本原理是認為不同處理組的均數間的差別基本來源有兩個：

(1)實驗條件，即不同的處理造成的差異，稱為組間差異。用變量在各組的均值與總均值之偏差方和的總和表示，記作SSb，組間自由度dfb。

(2)隨機誤差，如測量誤差造成的差異或個體間的差異，稱為組內差異，用變量在各組的均值與該組內變量值之偏差方和的總和表示，記作SSw，組內自由度dfw。

總偏差方和SSt=SSb+SSw。

組內SSw、組間SSb除以各自的自由度(組內dfw=n-m，組間dfb=m-1，其中n為樣本總數，m為組數)，得到其均方MSw和MSb，一種情況是處理沒有作用，即各組樣本均來自同一總體，MSb/MSw≈1。另一種情況是處理確實有作用，組間均方是由于誤差與不同處理共同導致的結果，即各樣本來自不同總體。那么，MSb>>MSw(遠遠大于)。