細(xì)菌不是都有鞭毛的，鞭毛是屬于細(xì)胞的特殊結(jié)構(gòu)，有的細(xì)菌有，有的細(xì)菌沒有。細(xì)菌的基本結(jié)構(gòu)如細(xì)胞壁、細(xì)胞膜、細(xì)胞質(zhì)、核質(zhì)才是所有的細(xì)菌都有的。細(xì)菌的特殊結(jié)構(gòu)還有菌毛、芽孢和莢膜，只有一部分細(xì)菌有鞭毛。

原生質(zhì)神經(jīng)伸出細(xì)胞外形成的鞭狀物，一條或多條，有運(yùn)動(dòng)、攝食等作用。鞭毛蟲以及各種動(dòng)植物的精子等都有鞭毛。是常見的細(xì)菌細(xì)胞器之一。

在某些菌體上附有細(xì)長并呈波狀彎曲的絲狀物，少則1-2根，多則可達(dá)數(shù)百根。這些絲狀物稱為鞭毛，作用是負(fù)責(zé)細(xì)菌的運(yùn)動(dòng)。

從一些原核細(xì)胞和真核細(xì)胞表面伸出的、能運(yùn)動(dòng)的突起。鞭毛較長，數(shù)目少；纖毛與鞭毛有相同的結(jié)構(gòu)，但較短，數(shù)目多。細(xì)菌的鞭毛則有完全不同的結(jié)構(gòu)。

鞭毛一般長約150微米，纖毛5～10微米，兩者直徑相，為0.01～0.03微米。大多數(shù)動(dòng)物和植物的精子都有鞭毛。精子及許多原生動(dòng)物都以鞭毛或纖毛為運(yùn)動(dòng)器。

具有鞭毛的細(xì)菌大多是弧菌、桿菌和個(gè)別球菌。

細(xì)胞表面的細(xì)長鞭狀原生質(zhì)突起，其功能為運(yùn)動(dòng)、攝食等，某些細(xì)菌菌體的一端、兩端或周圍也有鞭毛。主要類型有尾鞭型、茸鞭型等。尾鞭型：鞭毛的一種類型。在電鏡下觀察，鞭毛表面無茸毛(或鞭茸)。常見于綠藻門、輪藻門游動(dòng)孢子或精子的鞭毛，高等植物中的苔蘚和蕨類的精子均為尾鞭型的鞭毛。還有一些藻類和低等真菌的游動(dòng)細(xì)胞具1條尾鞭型的鞭毛和1條茸鞭型鞭毛。茸鞭型：鞭毛的一種類型。在電鏡下觀察，鞭毛表面具許多羽狀排列的茸毛(或鞭茸)。常見于裸藻、隱藻門的種類。在甲藻、褐藻以及一些低等真菌中，常見在同1個(gè)游動(dòng)細(xì)胞上具1條茸鞭型鞭毛，另1條為尾鞭型鞭毛。