新疆醫科大學厚博學院創辦于2003年， 是由新疆醫科大學舉辦的一所按新機制、新模式運作，充分依托新疆醫科大學綜合辦學優勢，具有濃郁地域的全日制普通本科層次獨立學院。目前，學院開設有臨床醫學、口腔醫學、藥學、醫學影像技術、醫學檢驗技術、護理學、公共事業管理、信息管理與信息系統等八個專業。

2012年，經教育部和自治區人民政府批準，新疆醫科大學與克拉瑪依市采取合作辦學的方式共同建設厚博學院。厚博學院定位為醫學類院校，學生規模期為5000人，遠期為10000人，未來發展方向為醫學類和非醫學類專業并存的綜合性本科院校。2015年，厚博學院正式遷入克拉瑪依市。克拉瑪依校區位于克拉瑪依市城南新區，規劃總面積1140余畝，總建筑面積24萬方米。校園由美國NBBJ公司規劃設計，學院建設完成后，硬件條件、基礎設施將達到國內一流水。

遵循“厚德、博學、篤志、力行”校訓，以培養實用型、復合型、高素質人才為目標，以人才市場需求為導向，以優質師資力量為基礎，以現代管理制度為保障，以過硬教學質量求發展，厚博學院將根據醫學科學發展最新趨勢，以優質教育資源全方位培養符合社會發展需要和人才市場需求的醫學各類人才。

新疆醫科大學厚博學院為2003年5月6日獲準成立，并根據2004年2月5日教育部教發函[2004]13 號文件正式批準，由新疆醫科大學舉辦的一所按新機制、新模式運作，充分依托、發揮新疆醫科大學綜合辦學優勢，中西醫并重，具有濃郁地域的本、專科層次的綜合性高等醫學院校。厚博學院現有教學管理科、學生管理科、財務管理辦公室、綜合辦公室等4個職能科室，8名工作人員。

新疆醫科大學厚博學院現有鯉魚山和克拉瑪依兩個校區，是國家教育部確認的獨立學院。

新疆醫科大學鯉魚山校區占地300多畝，1期工程共投資1.5個億，現建有1棟教學樓、1棟學生食堂，2棟學生公寓，總建筑面積達到8萬多方米。其中，形態學實驗室、機能學實驗室、計算機實驗室、語音室、浴室、圖書室、學生活動中心已陸續建成并投入使用，學習、生活設施日趨完善。2015年克拉瑪依校區投入使用。克拉瑪依校區占地2355畝。

申請舉辦厚博學院的新疆醫科大學，是一所集教學、科研、醫療為一體的綜合性醫科大學，目前有18所學院、4個系。擁有臨床醫學、藥學、公共衛生與預防醫學等3個博士后流動站；內科學、勞動衛生與環境衛生學、藥理學等3個博士學位授權點；37名博士生導師。另外，新疆醫科大學擁有35個二級學科碩士學位授權點，315名碩士生導師。

新疆醫科大學擁有5個省級重點學科，即，生物化學與分子生物學，藥理學、內科學、外科學，勞動衛生與環境衛生學；包蟲病實驗室、新疆地方病分子生物學實驗室等2個省級重點實驗室。