合肥工業大學有共4個校區，分別是屯溪路校區、翡翠湖校區、六安路校區、宣城校區。屯溪路校區、翡翠湖校區、六安路校區坐落在安徽省合肥市，簡稱“合肥校區”；宣城校區坐落在安徽省宣城市區。

合肥工業大學在安徽省省會合肥市設有屯溪路校區、翡翠湖校區、六安路校區和合肥工業大學智能制造技術研究院，在安徽省宣城市設有合肥工業大學宣城校區。學校先后榮獲第四屆全國文明單位和首屆“全國文明校園”等多個榮譽稱號。

屯溪路校區

合肥工業大學屯溪路校區（南校區），地處合肥市繁華路段，校區由屯溪路（南一環路）、馬鞍山路、九華山路、寧國路環繞，校區占地面積1250畝。

翡翠湖校區

2001年4月，合肥工業大學新校區開始建設，校長陳心昭命名新校區為合肥工業大學翡翠湖校區。

六安路校區

六安路校區為原安徽工學院校址，安徽工學院在“文化大革命”時期與合肥工業大學合并，1978年經國務院批準，在原址恢復安徽工學院。1997年1月重新與合肥工業大學合并，組建成新的合肥工業大學，當年6月掛牌，成為合肥工業大學六安路校區，也稱北校區。

宣城校區

合肥工業大學宣城校區位于位于安徽省宣城市宣州區薰化路301號，2011年，經教育部批準，合肥工業大學、宣城市人民政府共同建設合肥工業大學宣城校區。